ふと、iPhone / iPad App（アプリ）のバックアップを最後に行ったのは何時だったか確認したところ 1年程前だった。
iTunes でダウンロードしたアプリや、PC と同期した際、iTunes へ転送されたアプリの保存先は、設定を変更していない場合、以下の場所になります。
Mac OS X
~/Music/iTunes/iTunes Music/Mobile Applications
Windows Vista / 7
C:\Users\ユーザ名\Music\iTunes\Mobile Applications
Windows XP
C:\Documents and Settings\ユーザ名\My Documents\My Music\iTunes\Mobile Applications
この「Mobile Applications」フォルダの中に入っている .ipa ファイルが iPhone / iPad のアプリです。
まとめてバックアップをしてしまうなら「Mobile Applications」ごとコピーします。特定のアプリのみバックアップを行う場合は、アプリの .ipa ファイルをコピーしましょう。
バックアップからアプリを復元を行う場合は、iTunes を起動し、ライブラリの「App」を選択し、.ipa ファイルをドロップします。
「Mobile Applications」フォルダを入れ替えてしまえば、バックアップ状態に戻ります。
バックアップから復元したアプリの iTunes アカウントが異なる場合は iPhone / iPad へは転送できません。